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    课程简介:

         转录组基因数据分析是一个非常前卫的IT技术分支,但通过这次的课程,同学们对转录组基因数据分析将不再陌生。转录组数据分析一般分为所有基因挖掘、差异基因挖掘、表达量挖掘、高级工具挖掘四个步骤,在本次的课程中我们不仅要对转录组进行数据分析和挖掘,还对转录组技术理论进行了非常深入的研究和探讨,更进一步的进行了数据的可视化分析报告,这对于更好的理解以及转录组数据分析有更实际的应用。

    转录组基因数据分析实战

    实战转录组基因数据分析课程目录

    (1)\01、转录组基础
    ├─01、转录组基础(上).mp4
    ├─02、转录组基础(下).mp4
    ├─11-转录组概述(1).pdf
    ├─11-转录组概述.pdf
    (2)\02、Windows下转录组分析软件的安装
    ├─01、Windows下转录组分析软件安装.mp4
    ├─02、Windows软件安装-510.mp4
    ├─转录组数据分析软件安装-Windows.zip
    (3)\03、Linux下的软件安装和一键配置转录组运行环境
    ├─01、Linux下软件安装和一键配置转录组运行环境.mp4
    ├─02、Linux下软件安装-510.mp4
    ├─13-1-转录组软件安装-Linux(1).pdf
    ├─13-1-转录组软件安装-Linux.pdf
    (4)\04、转录组Salmon分析流程讲解
    ├─01、Salmon基础.mp4
    ├─02、Salmon实战操作.mp4
    ├─03、Salmon理论-510.mp4
    ├─04、Salmon实战-510.mp4
    ├─12-转录组分析流程Salmon(1).pdf
    ├─12-转录组分析流程Salmon.pdf
    ├─13_salmon_deseq2_go.zip
    ├─transcriptome_server.zip
    (5)\05、DESeq2差异基因分析理论和操作
    ├─01、DESeq2差异基因分析理论和操作1.mp4
    ├─02、DESeq2理论-510.mp4
    ├─03、DESeq2差异基因分析理论和操作2.mp4
    ├─04、DESeq2实战-510.mp4
    ├─14-差异基因分析理论和实战(1).pdf
    ├─14-差异基因分析理论和实战.pdf
    (6)\06、GO、KEGG富集分析理论和可视化讲解
    ├─01、GO KEGG富集分析理论和可视化讲解.mp4
    ├─02、GO KEGG msigdb富集分析和可视化实战.mp4
    ├─03、GO富集理论-510.mp4
    ├─04、GO富集操作+Cytoscape_clueGO-510.mp4
    ├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作(1).pdf
    ├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作.pdf
    ├─goeast.txt
    (7)\07、利用Cytoscape-clueGO进行富集分析
    ├─01、Cytoscape富集可视化Pathway通路映射.mp4
    ├─02、Cytoscape clueGO进行富集分析和网络可视化.mp4
    ├─03、Cytoscape理论和pathway-510.mp4
    ├─25-Cytoscape绘制网路通路图(1).pdf
    ├─25-Cytoscape绘制网路通路图.pdf
    ├─cytoscape演示数据.zip
    ├─KEGG.zip
    (8)\08、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解
    ├─01、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解(GO、KEGG、MsigDB).mp4
    ├─02、GSEA两组样品和时间序列富集分析.mp4
    ├─03、GSEA理论-510.mp4
    ├─04、GSEA实战-510.mp4
    ├─15_GSEA.zip
    (9)\09、二代和三代高通量测序原理
    ├─01、二代和三代高通量测序原理.mp4
    ├─02、中心法则测序应用-510.mp4
    ├─03、测序原理-510.mp4
    ├─21-二代测序平台和原理(1).pdf
    ├─21-二代测序平台和原理.pdf
    (10)\10、转录组STAR比对分析流程讲解
    ├─01、转录组STAR比对分析流程讲解.mp4
    ├─02、STAR有参操作解释-510.mp4
    ├─03、STAR有参操作总结-510.mp4
    ├─22-转录分析流程STAR(1).pdf
    ├─22-转录分析流程STAR.pdf
    (11)\11、转录组STAR比对分析实战与IGV可视化、比对评估、饱和性检测
    ├─01、转录组STAR比对分析实战和IGV可视化 比对评估 饱和性检测.mp4
    ├─02、IGV可视化-510.mp4
    ├─23-转录组分析流程-IGV(1).pdf
    ├─23-转录组分析流程-IGV.pdf
    (12)\12、STAR定量结果差异基因分析和与Salmon结果比较
    ├─01、STAR定量结果差异基因分析和与salmon结果比较.mp4
    ├─23_star_deseq2_go.zip
    (13)\13、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读
    ├─01、WGCNA理论-510.mp4
    ├─02、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读.mp4
    ├─24-WGCNA共表达网络分析(1).pdf
    ├─24-WGCNA共表达网络分析.pdf
    (14)\14、WGCNA共表达实战
    ├─01、WGCNA实战和网络可视化-510.mp4
    ├─02、WGCNA共表达实战.mp4
    ├─24_WGCNA.zip
    (15)\15、转录组组装和可变剪接分析理论和实战
    ├─01、转录组组装和可变剪接分析理论和实战.mp4
    ├─31-转录本拼装和可变剪接.pdf
    (16)\16、无参转录组分析理论
    ├─01、无参转录组分析理论.mp4
    ├─32-无参转录组组装和注释.pdf
    (17)\17、单细胞转录组概念
    ├─01、单细胞转录组概念.mp4
    ├─31-单细胞转录组基本概念.pdf
    (18)\18、单细胞转录组实战
    ├─01、10X拆库浏览.mp4
    ├─02、单细胞转录组数据获取-510.mp4
    ├─03、seurat-monocle-scater包解释和运行.mp4
    ├─32-单细胞转录组实战.pdf
    ├─33-单细胞转录组数据获取.pdf
    (19)\19、PCA、TSNE、单细胞理论和操作
    ├─01、PCA TSNE理论.mp4
    ├─02、PCA TSNE单细胞操作.mp4
    ├─34-PCA和单细胞可视化.pdf
    ├─PCA_scRNA.zip
    (20)\20、常用转录组资源数据库简介
    ├─01、常用转录组资源数据库简介.mp4
    ├─33-转录组案例分析和基因表达资源数据库.pdf
    (21)\21、常见图形解读
    ├─01、常见图形解读.mp4
    ├─02、常见图形解释-510.mp4
    ├─26-转录组常用图形解读(1).pdf
    ├─26-转录组常用图形解读.pdf
    (22)\22、AdobeIllustrator修图和拼图
    ├─01、AdobeIllustrator修图和拼图.mp4
    ├─36_AI.zip
    ├─36论文图表.pdf
    (23)\23、Linux基础(一)晚间额外课
    ├─01、Linux基础 (一)晚间额外课.mp4
    ├─Linux基础.zip
    ├─linux简介与实操.pdf
    (24)\24、Linux基础(二)晚间额外课
    ├─01、Linux基础(二)晚间额外课.mp4
    (25)\25、Excel便捷操作
    ├─01、excel操作-510.mp4
    ├─Excel.190511.pptx
    (26)\26、发表文章相关知识
    ├─01、发表文章-510.mp4
    ├─35_发表前准备.pdf
    (27)\27、两周后的答疑
    ├─01、两周后的答疑.mp4

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    助梦资源网 » 转录组基因数据分析实战_用数据分析生命科学与医学领域的最前沿实践

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